L’histoire des sciences étudie la construction des connaissances scientifiques dans un contexte social et économique. Il ne s’agit pas d’une simple chronologie de faits scientifiques mais de l’évolution d’idées, de concepts, d’une pensée et également d’institutions. Cet espace, utilisant au maximum les avantages didactiques des technologies (TICE), se concentre sur les travaux et inventions développés par ces scientifiques. Leurs pratiques relèvent d’une approche très similaire, la pratique expérimentale, d’où émergea la science moderne. De la machine à calculer de Blaise Pascal au micro-processeur, le visiteur peut découvrir un exemple d’évolution des techniques. Il est invité à manipuler une pascaline virtuelle, à feuilleter sur écran tactile l’Atlas minéralogique de Guettard et Lavoisier, ou encore, grâce à des interviews filmées, à prendre connaissance du travail réalisé sur les collections scientifiques du muséum. L’interactivité et les multiples animations permettent au visiteur d’acquérir plus facilement différentes notions et d’entrevoir leurs liens avec notre société actuelle.